依当事人的申请由法院调查收集的证据，在质证时作为提出申请的一方当事人的证据是可以质证的。但是如果是法院依职权自行调取的证据，基于法院中立的裁判地位，当事人就不能在庭审中对其进行质证了。虽然当事人可以质疑该证据的真实性、合法性、关联性，提出意见，但是不能同法院在法庭上就这些问题进行辩驳。如果法院在听取当事人意见以后，的确发现证据本身或者收集证据的方法存在问题，就应当自行撤回该证据。