一、依法开展改制单位的清产核资工作
在事业单位转制、改制过程中，坚持公有资产保值增值是一项基本原则。要依法维护国家、集体所有者的合法权益，就必须规范整个清产核资的操作程序。事业单位自身的资产产权界定、资产评估本身就是一个十分敏感而又引人关注的问题，特别是有些事业单位由于历史的原因，拥有的资产数额十分庞大，这个问题就更加突出。因此如何保证清产核资工作的顺利进行，防止某些人利用改制、转制之机，以各种非法手段侵吞公有资产，是摆在各级领导面前的一个必须认真对待的问题。我们认为，只有加强法律监督和控制，才能有效的保证清产核资工作的正常开展。
第一、改制单位的上级主管部门应加强对清产核资工作的指导和监督，在改制单位申请资产评估立项后，由主管部门委托具有资质的中介机构对改制单位进行资产评估。
第二、对涉及到改制单位产权界定、产权交易、资产处置方案的制订、改制单位的股权结构设置、资产转让等行为，应由律师出具法律意见书，确保整个改制、转制流程的合法性。
第三、加强民主监督，资产的评估结果、处置方案等须交由职工大会审议。
第四、对发生在转制过程中的违法犯罪行为必须依法处理。对于在转制、改制过程中隐匿资产的行为，一经发现，就要依法追究当事人法律责任。对于中介机构在承办业务时，同改制单位串通作弊、弄虚作假或隐瞒不报，出现重大疏漏、严重误导等导致国有资产重大流失、侵害其他产权主体合法权益的，也应依法追究责任。
二、改制方案的制定要坚持“三公”原则和职工民主管理
同国有企业改制一样，事业单位在改制过程中涉及的改制、转制方案的制订实施应坚持公开、公平、公正的原则，必须事先将改制方案提交职工(代表)大会审议通过。这既是在政治上保证职工群众的主人翁地位，调动广大职工的积极性和创造性，也是在制度上落实职工群众参与民主管理、民主监督。如果这项工作做得不好，往往会影响改制的正常进行，甚至还会给社会带来不稳定的因素。
第一、应做好单位职工的思想工作，让职工群众真正理解改制的内涵，使他们主动参予到改制过程中来，保证改制工作的顺利进行。
第二、应依法召开职工(代表)大会，对于清产核资的结果、改制方案等交由职工大会做成规范的决议。
第三、在改制过程中切实注意保护职工的合法权益，对涉及职工切身利益的决定应交由工会和职工大会讨论并形成决议。
三、根据单位不同情况决定企业形式
由于事业单位具有分布较广、类型复杂等特点，在转制、改制过程中不能就改制单位的形态进行“一刀切”，而是要根据各个单位的不同特点来决定其改制的形式；从改制单位的股权设置角度来说，也不能片面强调国有资本全部退出，而要根据各单位的不同情况，在鼓励经营者持大股的前提下，有选择的保留部分国有股份。
根据大多数事业单位的实际情况，按照现代企业制度的要求，改制为有限责任公司是一种常见的做法。有限责任公司具有注册资本要求较低、设立程序简单、出资方式灵活、治理结构设置灵活、改制成本低等特点，比较适合于那些参股人数较少、企业资产不是很多的企业。改制成有限责任公司可以从产权制度改革上一步到位，有利于企业的经营层、主要经营者和业务骨干持大股。
股份合作制企业是我国由计划经济向市场经济转轨过程中发展出来的、独具中国特色的企业组织形式。这种组织形式在历史上具有积极的意义，但总的来说，仍然是向现代企业制度过渡的一种中间形态。随着社会主义市场经济的发展和企业规模的壮大，目前许多股份合作制企业正走向规范的股份制。因此，我们认为，除了对那些职工入股愿望强烈、人数较多的单位外，一般不宜再采用这类组织形式。
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