然而，有关部门在起草草案的工作中却到这样的问题，即股份合作企业法要制定成一部什么样的法律：如果制定成市场主体性法律，则势必与公司法相重复，不制定市场主体性法律，那又制定成什么类型的法律，为此起草部门处于两难之中。

　　关于这个问题，部分人士认为，由于股份合作制是股份制的一种初级方式，从主体性内容方面，即企业如何设立，内外部关系如何规范方面来看，它完全可依据公司法执行，而对于难以适用公司法的一些特殊内容，主要是职工持股参与管理的权利和企业组织管理的一些具体做法，对此可依据公司法规定的原则单独制定法律予以规范。这一法律可作为股份合作制企业的股权和组织管理方面的法律，而不是一部独立的市场主体性法律，在法律归类上，可将其归于股份制企业的内部管理法。对于上述看法，也有人士持不同意见，他们认为，股份合作制企业从企业规模、组织管理、股权分类及其管理都与一般的股份制企业相区别，将其归于公司类，适用公司法显然不合适，我国企业形式虽有公司、合伙企业与独资企业之分，但也不多一个股份合作的种类，因此还是将其独立出来，制定一部专门的主体类法律为好。

　　对于上述两类意见，虽都有一定的道理，但都存在一定的问题，目前尚难作定论，有关立法部门还在作进一步的研究。