上诉人（原审被告、反诉原告）A公司。
法定代表人倪X。
委托代理人王X。
委托代理人翁X。
被上诉人（原审原告、反诉被告）B公司。
法定代表人朱X。
委托代理人范X、任X。
上诉人A公司（以下简称A公司）因建设工程分包合同纠纷一案，不服上海市奉贤区人民法院（2011）奉民三（民）初字第2293号民事判决，向本院提起上诉。本院于2012年3月20日受理后，依法组成合议庭于2012年4月10日公开开庭审理了本案，上诉人A公司之委托代理人翁X、王X，被上诉人B公司（以下简称B公司）之委托代理人范X、任X到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
原审认定，四川汶川地震后，发包人上海对口支援灾后重建都江堰项目管理有限公司与B公司签订《都江堰市卫生系统灾后过渡性安置板房建设工程施工合同》，约定由B公司承建都江堰市市属医疗卫生机构过渡板房，共12个点位，搭建24,440平方米；管理费、利润等费率按5%执行；现场成品安装的彩钢板芯板板材工程量按实计算，损耗率按6%计算；彩钢板芯板板材价格每平方米130元、钢结构每吨9,200元（含制作安装及损耗）不锈钢包框每公斤40元、门每平方米260元、窗（带砂）每平方米360元、彩钢折件每米4元、10公分槽铝每米15元、螺栓铆钉硅膏等辅材及机械费按每米8元计、运费按每吨1,600元计算、彩钢板房的安装人工费按每平方米60元计、往返路费按每人500元计算、伙食费按每人每天20元计算等内容。
2008年7月16日、7月24日、8月8日、9月12日，B公司与A公司先后签订4份《都江堰援建医院购销意向合同》，分别由A公司承建都江堰市中医院建筑面积2,415平方米（以下均为建筑面积）、都江堰市人民医院住院部食堂349.45平方米、门诊室1,122.7平方米、建筑间连廊投影面积2,076平方米、都江堰市人民医院住院部4,067平方米、都江堰沿江医院工程1,200平方米。
第一份合同签订后，A公司在准备施工材料后，首先施工都江堰市人民医院住院部工程，施工不久，A公司被责令停止施工。为此，A公司发函给上海建工集团有限公司，要求给予撤离方案并清点现场备料，减少因等工、误工造成的扩大损失。B公司回函，要求A公司清点材料并妥善保管，以便向管理公司进行索赔。嗣后，为消耗已拉至现场的已备材料，B公司将都江堰中医院本部、沿江医院、柳街医院三个点的工程交由A公司承建。在施工过程中，B公司和监理单位对A公司完成的工程量进行过签证确认。2008年10月15日，B公司出具完工单，载明：已完成都江堰市沿江医院医疗点彩板房二幢、柳街镇医疗点彩板房一幢、中医院彩板房一期五号房、二期一幢（原人民医院住院部改造项目食堂用房）及原人民医院住院部改造项目恢复隔墙154间安装任务，于2008年10月14日经都江堰市质检部门验收合格。同日，B公司对A公司在现场的施工材料清点，并确认数量。期间，A公司曾为上海已备料的损失问题向B公司发过电子邮件，并详列了清单，但B公司未予书面回复。
2011年7月28日，B公司诉至法院，请求判令A公司返还B公司多支付的工程款1,066,707元。后B公司增加诉讼请求，请求判令A公司支付多收取工程款的利息93,063.60元（自2010年2月1日计算至2011年8月6日，按银行同期贷款利率计算）。A公司则提起反诉，请求判令：1、B公司支付工程款2,298,466.17元；2、B公司支付上述工程款的利息损失200,000元(自2010年2月1日计算至判决生效日止，按银行同期贷款利率计算，暂计至2011年7月31日)。
原审庭审中，双方对已付工程款一致确认为2,861,700元；对B公司提供的甲供料一致确认为宝钢板钢175.86吨；对工程款的利息起算日期一致确认为2010年2月1日。
经法院组织调解，由于双方对工程造价有严重分歧，致使调解不成。