如果有以下情况出现，是不能通过民政机关办理协议手续的：
1.一方要求离婚的。也就是说，一方要求离婚，另一方不同意的，要求离婚的当事人只能向法院起诉要求离婚。
2.双方要求离婚，但是对子女、夫妻一方生活困难的经济帮助、财产及债务处理等事项未达成协议的，当事人只能通过法院解除婚姻关系。虽然双方都同意离婚，但是对于财产分割、子女抚养等分歧不能达成一致意见的，也不能到民政局办理协议离婚手续，而只能通过法院解决双方的争议，从而以诉讼手段解除双方的婚姻关系。
3.一方或者双方当事人为限制民事行为能力或者的。如果一方为精神病患者，被医院确诊为无民事行为能力，民政局是不可以受理离婚申请的，因为民政局不能确定当事人是否具备真实自愿的离婚意愿。同样，法院也不会直接受理被确定为无民事行为能力的当事人的离婚起诉，只能由另一方当事人起诉。若当事人被医学鉴定为无民事行为能力人的，包括当事人亲属在内的任何其他人都不能代替当事人起诉离婚。如果对方当事人是无民事行为能力人，当事人可以向法院提起离婚诉讼，而由对方当事人的法定监护人作为对方当事人的代理人参加诉讼。
4.未办理登记的。如果当事人是事实婚姻或同居关系，根本没有办理结婚登记，如果现在闹离婚，只能到法院办理离婚手续，民政局不予办理。根据现行的法律规定，符合结婚实质要件的当事人双方是在1994 年2月1日以前，虽然未登记结婚，但是以夫妻名义在一起同居生活的，构成事实婚姻。但如果现在解除事实婚姻关系，只能到法院办理离婚手续;1994年2月 1日以后，男女双方在一起生活，只是同居关系，可以自行解除，不需要到民政局或法院办理解除关系手续，只是双方有财产或子女抚养纠纷，才可直接向法院起诉。
5.双方是在国外登记结婚的。随着时代的发展，越来越多的中国人和外国人结婚，是在外国登记的，或是在港、澳、台注册的，对于不在中国大陆登记的婚姻，当事人要解除，不管双方是否能够达成协议，只能通过人民法院以诉讼方式离婚。
一、感情确已破裂是诉讼离婚的法定条件
《婚姻法》第32条第2款规定：“人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。”这一规定将“夫妻感情确已破裂”作为我国离婚制度中判决离婚的法定理由，这也是人民法院处理离婚纠纷决定是否准予离婚、是否准予解除夫妻关系的基本原则。感情确已破裂是客观存在的事实，是准予或不准予离婚的法定条件，同时也是判决离婚的实质要件;因此，夫妻感情是否确已破裂，成为法院判决是否准予离婚的唯一的、根本的法定标准。
二、关于如何确定夫妻感情是否确已破裂
我国现行的《婚姻法》第32条列举了下列五种具体情形：
(1)重婚或有配偶者与他人同居的。重婚指有配偶者又与他人登记结婚或者与他人以夫妻名义共同生活。有配偶者与他人同居是指有配偶者与婚外异性，不以夫妻名义，持续、稳定地共同生活。这两种行为都是违反《婚姻法》一夫一妻原则、破坏婚姻秩序地严重过错行为。夫妻一方重婚或者与他人同居的，经调解无效，应当认为夫妻感情确已破裂...
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