尽管软件是否可以申请专利在世界上还存在激烈的争论，反对者认为无限的专利只会影响创新的努力，争议归争议，但是美国、日本、欧洲等发达地区已经开始重新修改了各自的专利审查指南。增补了许多有关商业方法软件发明的审查指导意见，可以认为目前三方专利局已不再注重软件可专利性问题的讨论，而是更多关注和讨论软件发明的具体判断标准，即专利审查的第二道门槛：专利三性的问题。欧盟委员会批准了对欧盟软件专利指令进行的有争议的修改，为在欧洲广泛申请软件专利铺平了道路。

欧洲各国已经授予了多达30000万项各种软件专利，光是一个网上购物就已经有了20个专利。某些软件一旦被授予专利，程序员们就很难绕得开，他们面临的将是一个专利雷区，只有支付专利费才能开发软件，所有的公司将必须为其软件产品提供专利许可费用，这些公司并没有真正的产品或服务业务，仅仅依靠专利许可证的发布而获得盈利。

在我国一向不注意保护自己的知识产权，加入世贸后，被国外的公司挥舞知识产权的大棒打得晕头转向，如果还不注意保护自己的知识产权，可能会出现类似美国的大型企业在专利之争中占优势地位的情况。

我国也开始讨论软件的申请专利问题。有的软件公司开始为他们开发的软件申请专利，据说瑞星公司在国内外申请了至少六项专利。

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