软件著作权登记申请流程是：

1、著作权人提交软件的鉴别材料、软件著作权登记申请表、本人身份证明等文件;

2、中国版权保护中心审查申请材料，且期限为自受理日起60日内;

3、申请符合规定的，予以登记，发给相应的登记证书，并予以公告。

法律依据

《计算机软件著作权登记办法》第八条

合作开发的软件进行著作权登记的，可以由全体著作权人协商确定一名著作权人作为代表办理。著作权人协商不一致的，任何著作权人均可在不损害其他著作权人利益的前提下申请登记，但应当注明其他著作权人。

第九条

申请软件著作权登记的，应当向中国版权保护中心提交以下材料：

(一)按要求填写的软件著作权登记申请表;

(二)软件的鉴别材料;

(三)相关的证明文件。

第十九条

对于本办法第九条和第十四条所指的申请，以收到符合本办法第二章规定的材料之日为受理日，并书面通知申请人。

第二十条

中国版权保护中心应当自受理日起60日内审查完成所受理的申请，申请符合《条例》和本办法规定的，予以登记，发给相应的登记证书，并予以公告。

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