在亲子鉴定确认为非婚生子后，法院除会作出准予离婚的判决，还会应当事人的要求作出以下的判决：
1、子女由女方抚养，并由女方承担子女的抚育费。当亲子鉴定一旦证实子女非男方所在，丈夫就没有义务负担非婚生子女的抚育费。其日后的生活费、教育费、医疗费等由女方承担。
2、女方承担男方一定数额的精神赔偿金。
3、女方应返还男方原所承担的子女抚养费。对男方已经付出的抚养费应当酌情返还。对于返还多少，法律没有作出具体规定。具体数目应根据女方的偿还能力及男方的收入抚养情况而定。
由于鉴定结果本身具有一定的证据属性，根据条文或权威司法解释表明“亲子鉴定”可以作为法定证据使用。
由于该行为违反了夫妻之间的互相忠实、互相尊重的法律规定，且造成了男方的精神痛苦，属于有过错责任的一方，应当承担精神损害赔偿责任。男方可以主张已经花费到子女身上的抚养费，并主张赔偿精神损失。同时，分割夫妻共同财产时，可以根据照顾无过错方原则，对男方作出比较有利的财产分割。
如果女方不同意进行法院所要求的亲子鉴定，法院会根据现有证据，会倾向于认定男方已经完成举证责任，推定孩子与父亲不具有生物上的亲子关系，会要求女方对男方进行损害赔偿。
离婚时也会根据过错责任，将夫妻共同财产多分给男方一部分。
《民法典》第一千零九十一条，有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：
（一）重婚；
（二）与他人同居；
（三）实施家庭暴力；
（四）虐待、遗弃家庭成员；
（五）有其他重大过错，这一条款的增设使法院在处理离婚案件时，针对一方过错情形的具体程度，可以直接适用该条款判决过错方向无过错方支付损害赔偿金。
