建设工程合同备案流是：
1.网上申报。承包人登录政府门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表；
2.办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续；
3.正式签发合同备案表。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
法律快车提示：《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第47条规定：订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。由此可知建设工程合同的备案是有期限的，要在7日内到指定的部门备案。
