商标使用费不能在税前扣除。商标使用费属于特许权使用费之一，法律明确规定了，企业内部各营业机构之间缴纳的特许权使用费，不得税前扣除.由于企业所得税法采用企业所得税，企业分支机构属于企业总部的组成部分，不是外部独立的实体，不能成为独立的企业所得税纳税人，应当由企业总部统一代表进行汇总纳税。不得税前扣除的特许权使用费由干母公司与子公司属干不同独立法人企业，存在着控制与被控制的关联关系，应当按照独立企业之间的公平交易原则来确定商标使用费的价格，作为企业正常的费用进行税务处理。