在司法实践中，一些地方把正常的经济纠纷当做经济犯罪来处理，甚至导致发生冤错案件，引发社会强烈反响。颜茂昆表示，此次《意见》中专门设立规定：应严格区分经济纠纷与经济犯罪的界限，坚决防止把经济纠纷当作经济犯罪处理：“经济纠纷和经济犯罪，一个是平等主体之间的纠纷，一个是严重侵害社会的行为，他们承担责任的方式也不一样，这两者如果不加以区分，会造成非常严重的后果。实践中发生把经济纠纷认定为刑事犯罪，导致了冤错案件的发生。人民法院对于检察机关指控的犯罪，要严格审查、严格标准，要发挥审判最后一道防线的作用，坚决防止把经济纠纷认定为刑事犯罪，坚决防止造成冤错案件。”
为依法处理好历史形成的产权申诉案件，最高人民法院针对《意见》中相关规定，专门印发《关于依法妥善处理历史形成的产权案件工作实施意见》，明确了办案范围和工作重点。最高人民法院审判监督庭副庭长滕伟强调，各级人民法院应坚持实事求是、平等保护、依法纠错、纠防结合等原则，做好相关案件的纠正工作：“对改革开放以来做出的涉及重大财产处置的产权纠纷，以及民营企业和投资人违法犯罪的生效裁判，当事人、案外人提出申诉的，人民法院要依照法律规定，及时审查，认真甄别。注重查清案件事实和焦点问题，厘清相关法律政策问题。对符合再审条件的申诉案件，依法启动再审程序；对确有错误的生效裁判，坚决予以纠正。”
