检察机关以贪污直接受理了一起案件并提起公诉。法院经审理认定起诉书指控的被告人犯罪事实清楚，有充分的证据证明被告人的行为构成犯罪。但在案件定性上，法院认定的罪名与检察机关起诉指控的罪名不一致，法院认定被告人犯盗窃罪，而检察机关始终坚持自己的定性。请问：应如何处理这种情况?
